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发表于 2017-10-28 22:42:33 | 只看该作者 回帖奖励 |倒序浏览 |阅读模式
现有10帧数据,1帧里143个数,每一帧都会得到m值并将其记录在(17,file='NUMH.txt') 中,现在问题是生成的这个文件是空的,单独抽出1帧计算是有输出的,不知问题在哪,望各位帮助,谢谢。
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     program analysis Hbond between ON and NN
      implicit none
      real(4)::N(16,3),O(24,3),H(63,3)
      real(4)::S(8,3),C(32,3)
      character::u
      real(4)::NX(16),NY(16),NZ(16)
      real(4)::OX(24),OY(24),OZ(24)
      real(4)::HX(63),HY(63),HZ(63)
      real(4)::RNO(384),RNH(1008)
      integer::i,j,k,nn,m   
c     open(17,file='NUMH.txt')  
      open(11,file='TRAJEC.xyz')      
     
      do i=1,10
        
          read(11,*)u
          read(11,*)u,u
          open(14,file='N.txt')
          do k=1,16
            read(11,*)u,N(k,:)
            write(14,*)'N',N(k,:)
          enddo
          close(14)
          do k=1,8
            read(11,*)u,S(k,:)
          enddo
          
          open(15,file='O.txt')
          do k=1,24
            read(11,*)u,O(k,:)
            write(15,*)'O',O(k,:)
          enddo
          close(15)
          do k=1,32
            read(11,*)u,C(k,:)
          enddo
          
          open(16,file='H.txt')
          nn=0
          do k=1,63
            nn=1+nn
            read(11,*)u,H(k,:)
            write(16,*)'H',nn,H(k,:)
          enddo
          close(16)
          call distin(NX,NY,NZ,OX,OY,OZ,HX,HY,HZ,nn,RNO,RNH,u,m)
          write(17,*)m
      enddo
      close(17)
      close(11)
      end
      
      subroutine distin(NX,NY,NZ,OX,OY,OZ,HX,HY,HZ,nn,RNO,RNH,u,m)
      implicit none
      real(4)::NX(16),NY(16),NZ(16)
      real(4)::OX(24),OY(24),OZ(24)
      real(4)::HX(63),HY(63),HZ(63)
      real(4)::nn(63),RNO(384),RNH(63)
      real(4)::THETA(63),COSYTHETA(63)
      real(4)::VNOX(63),VNOY(63),VNOZ(63)
      real(4)::VNHX(63),VNHY(63),VNHZ(63)
      character::u
      integer::i,j,k,m
      open(14,file='N.txt')
      open(15,file='O.txt')
      open(16,file='H.txt')
      open(17,file='NUMH.txt')
      
      do i=1,16
        read(14,*)u,NX(i),NY(i),NZ(i)
      enddo
      close(14)
      do i=1,24
        read(15,*)u,OX(i),OY(i),OZ(i)
      enddo      
      close(15)
      do i=1,63
        read(16,*)u,nn(i),HX(i),HY(i),HZ(i)
      enddo
      close(16)
      do i=1,16
        do j=1,24
          RNO(i)=sqrt((NX(i)-OX(j))**2+(NY(i)-OY(j))**2+
     X                    (NZ(i)-OZ(j))**2)
          if(RNO(i).lt.2.6) then
            do k=1,63
               m=0.d0+k
              RNH(k)=sqrt((NX(i)-HX(k))**2+(NY(i)-HY(k))**2+
     X                    (NZ(i)-HZ(k))**2)
              if(RNH(k).lt.1.4) then
              
              VNOX(k)=OX(j)-NX(i)
              VNOY(k)=OY(j)-NY(i)
              VNOZ(k)=OZ(j)-NZ(i)
              VNHX(k)=HX(k)-NX(i)
              VNHY(k)=HY(k)-NY(i)
              VNHZ(k)=HZ(k)-NZ(i)
              
              COSYTHETA(k)=(VNOX(k)*VNHX(k)+VNOY(k)*VNHY(k)+VNOZ(k)*VNHZ(k))/
     X                                   RNO(i)/RNH(k)
     
                 THETA(k)=ACOS(COSYTHETA(k))
                if(THETA(k).lt.0.5) then
                m=m
                    write(17,*)m
                endif
              endif
            enddo
          endif
        enddo
      enddo
      return
      end

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沙发
发表于 2017-10-29 10:14:03 | 只看该作者
你在主程序里 open(17,file='NUMH.txt') ,在子程序里就不需要Open了。
一般也不需要在子程序里write(17
否则你会输出2次。

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 楼主| 发表于 2017-10-29 13:18:42 | 只看该作者
fcode 发表于 2017-10-29 10:14
你在主程序里 open(17,file='NUMH.txt') ,在子程序里就不需要Open了。
一般也不需要在子程序里write(17
否 ...

  多谢,我修改了下程序,现在问题是当不加l=1,10时,做单帧计算可以输出文件12,但是加上l=1,10时,文件12的大小是0bytes,不知是不是这行加的语法又问题,因为要分析的TRAJEC.xyz文件有10帧。多谢!
[Fortran] 纯文本查看 复制代码
      program analysis Hbond
      implicit none
      real(4)::NX(16),NY(16),NZ(16)
      real(4)::OX(24),OY(24),OZ(24)
      real(4)::HX(63),HY(63),HZ(63)
      real(4)::S(8,3),C(32,3)
      real(4)::RNO(384),RNH(63)
      real(4)::THETA(63),COSYTHETA(63)
      real(4)::VNOX(63),VNOY(63),VNOZ(63)
      real(4)::VNHX(63),VNHY(63),VNHZ(63)
      character::u
      integer::i,j,k,m,l
      open(11,file='TRAJEC.xyz')
      do l=1,10      
        read(11,*)u,u,u
        do j=1,16
          read(11,*)u,NX(j),NY(j),NZ(j)          
        enddo
        do j=1,8
          read(11,*)u,S(j,:)
        enddo
        do j=1,24
          read(11,*)u,OX(j),OY(j),OZ(j)
        enddo
        do j=1,32
          read(11,*)u,C(j,:)
        enddo
        do j=1,63
          read(11,*)u,HX(j),HY(j),HZ(j)
        enddo
        
        do i=1,16
          do j=1,24
            open(12,file='NUMH.txt')
            RNO(i)=sqrt((NX(i)-OX(j))**2+(NY(i)-OY(j))**2+
     X                    (NZ(i)-OZ(j))**2)
            if(RNO(i).lt.2.6) then
              do k=1,63
                 m=0.d0+k
                RNH(k)=sqrt((NX(i)-HX(k))**2+(NY(i)-HY(k))**2+
     X                    (NZ(i)-HZ(k))**2)
                if(RNH(k).lt.1.4) then
              
                VNOX(k)=OX(j)-NX(i)
                VNOY(k)=OY(j)-NY(i)
                VNOZ(k)=OZ(j)-NZ(i)
                VNHX(k)=HX(k)-NX(i)
                VNHY(k)=HY(k)-NY(i)
                VNHZ(k)=HZ(k)-NZ(i)
              
                COSYTHETA(k)=(VNOX(k)*VNHX(k)+VNOY(k)*VNHY(k)+VNOZ(k)*VNHZ(k))/
     X                                   RNO(i)/RNH(k)
     
                 THETA(k)=ACOS(COSYTHETA(k))
                  if(THETA(k).lt.0.5) then                    
                    write(12,*)l
                      write(12,*)k
                  endif
                endif
              enddo
            endif
          enddo
        enddo
      enddo
      end

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发表于 2017-10-29 14:16:07 | 只看该作者
open(12,file='NUMH.txt')
放到循环外面去,你要慎重考虑open语句的位置。

你需要知道这些事情:
1.文件打开之后,在关闭之前,不能再次打开。
2.文件关闭之后,重新打开,如果写入内容,默认会覆盖原有内容。

所以总体的习惯是,在需要文件之前,打开。然后陆陆续续写入。当不需要写入之后,再关闭。

很少需要把open写在循环里面,这种比较少(除非批量处理多个文件)。如果你确实需要这样,别忘了close

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 楼主| 发表于 2017-10-29 14:21:58 | 只看该作者
fcode 发表于 2017-10-29 14:16
open(12,file='NUMH.txt')
放到循环外面去,你要慎重考虑open语句的位置。

修改之后,文件12依然没有大小
[Fortran] 纯文本查看 复制代码
      program analysis Hbond
          implicit none
          real(4)::NX(16),NY(16),NZ(16)
          real(4)::OX(24),OY(24),OZ(24)
          real(4)::HX(63),HY(63),HZ(63)
          real(4)::S(8,3),C(32,3)
          real(4)::RNO(384),RNH(63)
          real(4)::THETA(63),COSYTHETA(63)
      real(4)::VNOX(63),VNOY(63),VNOZ(63)
          real(4)::VNHX(63),VNHY(63),VNHZ(63)
          character::u
          integer::i,j,k,m,l
          open(11,file='TRAJEC.xyz')
          open(12,file='NUMH.txt')
c          do l=1,10      
            read(11,*)u,u,u
                do j=1,16
                  read(11,*)u,NX(j),NY(j),NZ(j)                  
                enddo
                do j=1,8
                  read(11,*)u,S(j,:)
                enddo
                do j=1,24
                  read(11,*)u,OX(j),OY(j),OZ(j)
                enddo
                do j=1,32
                  read(11,*)u,C(j,:)
                enddo
            do j=1,63
              read(11,*)u,HX(j),HY(j),HZ(j)
            enddo
                
                do i=1,16
              do j=1,24
                    RNO(i)=sqrt((NX(i)-OX(j))**2+(NY(i)-OY(j))**2+
     X                            (NZ(i)-OZ(j))**2)
                if(RNO(i).lt.2.6) then
                      do k=1,63
                             m=0.d0+k
                            RNH(k)=sqrt((NX(i)-HX(k))**2+(NY(i)-HY(k))**2+
     X                            (NZ(i)-HZ(k))**2)
                    if(RNH(k).lt.1.4) then
                          
                            VNOX(k)=OX(j)-NX(i)
                            VNOY(k)=OY(j)-NY(i)
                            VNOZ(k)=OZ(j)-NZ(i)
                            VNHX(k)=HX(k)-NX(i)
                            VNHY(k)=HY(k)-NY(i)
                            VNHZ(k)=HZ(k)-NZ(i)
                          
                            COSYTHETA(k)=(VNOX(k)*VNHX(k)+VNOY(k)*VNHY(k)+VNOZ(k)*VNHZ(k))/
     X                                                   RNO(i)/RNH(k)
         
                             THETA(k)=ACOS(COSYTHETA(k))
                      if(THETA(k).lt.0.5) then                                                      
                                        write(12,*)l
                                      write(12,*)k
                                  endif
                            endif
                          enddo
                    endif
                  enddo
            enddo
c          enddo
          end

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